O Núcleo Apostólico Manaus é pensado como instância de cuidado da cura personalis e cura apostólica. Articulação e colaboração entre obras e serviços apostólicos para favorecer o trabalho em rede e a transversalidade da missão na Preferência Apostólica Amazônia – PAAM e de toda Província dos Jesuítas do Brasil. Tem como Superior e Coordenador de Núcleo o Pe. Sandoval Rocha, SJ.

Jesuítas em missão neste núcleo:

Pe. Rogério Mosimann da Silva, SJ

Comunidade São Francisco Xavier
 – Delegado do Provincial Jesuíta do Brasil para a Preferência Apostólica Amazônia (PAAM)

Pe. Sandoval Alves Rocha, SJ

Comunidade São Francisco Xavier
– Superior da Comunidade Jesuíta
– Coordenador do Núcleo Apostólico Manaus
– Responsável, na Amazônia, pela parceria com a PUC-Rio

Pe. Sílvio Marques Sousa Santos, SJ

Comunidade São Francisco Xavier
– Diretor do Serviço Amazônico de Ação, Reflexão e Educação Socioambiental (SARES)

Pe. Adriano Luís Hahn, SJ

Comunidade São Francisco Xavier
– Coordenador de projetos do Serviço Amazônico de Ação, Reflexão e Educação Socioambiental (SARES)

Pe. Silas Moesio Maciel da Silva, SJ

Comunidade São Francisco Xavier
– Diretor do Centro MAGIS Amazônia
– Responsável pela frente apostólica Juventude e Vocações e pela articulação das juventudes no território da PAAM

Pe. Juan Fernando López Pérez, SJ

Comunidade São Francisco Xavier
– Equipe itinerante
– Ministérios junto às populações ribeirinhas, indígenas e grupos marginalizados urbanos
– Assessor da Rede Itinerante da Confederação Latino-Americana de Religiosas/os (CLAR)

Pe. Urbano Rodolfo Mueller, SJ

Comunidade São Francisco Xavier
– Vida e missão com os povos indígenas em parceria com o Conselho Indigenista Missionário (CIMI) em Atalaia do Norte, AM

Pe. Pablo Antonio Mora Mendoza, SJ

Comunidade São Francisco Xavier
– Coordenador da Rede de Educação Intercultural Bilíngue da Amazônia (REIBA)

Pe. Alex Palmer Sampaio Ribeiro, SJ

Comunidade João Bosco Burnier
– Vice Superior
– Pároco da Área Missionária Santa Margarida de Cortona

Pe. José Paulino Martins, SJ

Comunidade João Bosco Burnier
Província do Brasil
– Diretor da Casa de Retiros e Formação Ir. Vicente Cañas
– Articula a Espiritualidade Inaciana na Preferência Apostólica Amazônia (PAAM)

Pe. Emílio Magro Moreira, SJ

Comunidade João Bosco Burnier
– Orientador de Exercícios Espirituais inacianos
– Assessor do Serviço Inaciano de Espiritualidade (SIES)
– Colabora na Área Missionária Santa Margarida de Cortona

Ir. João Luiz de Castro, SJ

Comunidade João Bosco Burnier
– Membro da Equipe Itinerante
– Ministérios entre as populações ribeirinhas, indígenas e junto a grupos marginalizados urbanos